Όπως ανέφερε στην εισήγησή του ο Δήμαρχος κ. Σπυρίδων Σοφράς η μελέτη ολοκληρώθηκε το 1999 και εγκρίθηκε το 2002 από την ΕΥΔΑΠ και το 2004 από το ΥΠΕΣΔΑ.
Το 2005 η προηγούμενη Δημοτική Αρχή επέτυχε τη χρηματοδότηση του έργου από το Ταμείο Συνοχής της Ε.Ε. κατά 75% με χρονικό περιορισμό για την ολοκλήρωση του έργου μέχρι το Μάρτιο του 2009.
Στη συνέχεια προχώρησε στην σύναψη σύμβασης με την εταιρεία BUMG η οποία αναλάμβανε τα καθήκοντα τεχνικού συμβούλου του έργου, όπως προβλεπόταν από το Ταμείο Συνοχής.
Η εταιρεία BUMG πρότεινε στο Δήμο την τροποποίηση της μελέτης και την κατασκευή του έργου κατά 40% με το αναρροφητικό σύστημα (VACIUM) λόγω του μεγάλου βάθους που προβλεπόταν από τη μελέτη, της ιδιομορφίας των εδαφών και της εμπειρίας που υπήρχε από το έργο της αποχέτευσης της περιοχής Παλουκίων.
Το Δημ. Συμβούλιο Σαλαμίνας ενέκρινε την προμελέτη της τροποποίησης στις 22/11/2006 (με μοναδικό μειοψηφήσαντα τον κ. Αντ. Χατζή) και στις 19/12/2006 αποφάσισε ΟΜΟΦΩΝΑ την δημοπράτηση του έργου στις 13/2/2007, οπότε και πραγματοποιήθηκε.
Στις 21/2/2007, οκτώ μόλις ημέρες μετά τη δημοπράτηση του έργου, ο επικεφαλής του συνδυασμού «ΕΝΟΤΗΤΑ» κ. Μακρής και οι Δημοτικού Σύμβουλοι Όμηρος Παπασάββας, Ισιδώρα Παπαθανασίου - Νάννου (η οποία είχε υπερψηφίσει την τροποποίηση της μελέτης), Νίκος Αγαπίου και Ισιδωρος Τσούτσουρας με έγγραφό τους προς την ΕΥΔΑΠ ενέπλεξαν το έργο σε διαδικαστικά και νομικά θέματα, ενώ ο κ. Μακρής προσέφυγε στο Σώμα Ελεγκτών Δημόσιας Διοίκησης ζητώντας τον έλεγχο όλης της διαδικασίας που ακολουθήθηκε.
Το πόρισμα των Ελεγκτών Δημόσιας Διοίκησης που εκδόθηκε στις 7 Ιουνίου 2007, δεν διέταξε την διακοπή της διαδικασίας αλλά πρότεινε στο Δήμο κάποιες διαδικαστικές διορθώσεις.
Το Δημοτικό Συμβούλιο Σαλαμίνας, μπροστά στον κίνδυνο να χαθούν τα χρήματα της Ε.Ε., αποφάσισε στις 29/6/07 τη συνέχιση της εκτέλεσης του έργου. Η απόφαση αυτή απορρίφθηκε από την Περιφέρεια για τυπικούς λόγους αλλά η Επιτροπή του άρθρου 152, στην οποία προσέφυγε ο Δήμος ακύρωσε την απόφασή της Περιφέρειας και δικαίωσε το Δήμο.
Στη συνέχεια το 5ο κλιμάκιο του Ελεγκτικού Συνεδρίου, το οποίο εξετάζει τη νομιμότητα όλων των έργων που χρηματοδοτούνται από την Ε.Ε. με ποσό πάνω από 1 εκατομ. Ευρώ, απέρριψε την υπογραφή της σύμβασης με το μειοδότη του έργου για να έρθει η Ολομέλεια του ίδιου Δικαστηρίου η οποία έκανε δεκτή την προσφυγή του Δήμου και επέτρεψε την έναρξη των εργασιών.
Όλες αυτές οι νομικές διαδικασίες στις οποίες ενέπλεξαν το Δήμο ο επικεφαλής και οι Δημ. Σύμβουλοι του συνδυασμού «Ενότητα», αλλά και δημοσιεύματα του Τοπικού τύπου και ιδιαίτερα της εφημερίδας «ΝΕΑ ΣΑΛΑΜΙΝΑ (αποσπάσματα της οποίας παρουσίασε ο κ. Δήμαρχος) προκάλεσαν καθυστέρηση της έναρξης εργασιών του έργου κατά ένα μεγάλο χρονικό διάστημα. Γι’ αυτό ο Δήμος ζήτησε και πέτυχε από το Ταμείο Συνοχής της Ε.Ε. την παράταση της προθεσμίας ολοκλήρωσης του έργου ώστε να μην χαθεί η χρηματοδότηση που είχε εγκριθεί.
Όμως οι καταγγελίες επώνυμες ή ανώνυμες συνεχίστηκαν. Η Εισαγγελία Πειραιά, παίρνοντας αφορμή από δημοσίευμα της εφημερίδας «ΝΕΑ ΣΑΛΑΜΙΝΑ», διέταξε εισαγγελική έρευνα, ενώ ο κ. Μακρής υπέβαλε μήνυση εναντίον του Δημάρχου κ. Σπ. Σοφρά, του π. Δημάρχου κ. Βαγγέλη Αγαπίου και του προϊσταμένου της Τεχνικής Υπηρεσίας κ. Βλάση Λιαροκάπη για δήθεν παρανομίες κατά τη διαδικασία εκτέλεσης του έργου.
Στη συνέχεια εμφανίστηκαν οι «σύγχρονοι κουκουλοφόροι». Ανύπαρκτος συμπολίτης με τυχαίο όνομα Δημ. Νάννος και διεύθυνση κατοικίας Λ. Σαλαμίνας 37, απέστειλε στον Εισαγγελέα του Αρείου Πάγου κ. Σανιδά καταγγελία την οποία συνόδευε με αποκόμματα της τοπικής εφημερίδας «Νέα Σαλαμίνα» του κ. Δημ. Ροκίδη και των εντύπων του Πειραιά «Νέος Λόγος» και «Λιμάνι» του κ. Δημ. Κατσικάρη με την οποία κατηγορεί το Δημοτικό Συμβούλιο Σαλαμίνας για παράνομες αποφάσεις, κάνει λόγο για υπέρβαση της δαπάνης του έργου κατά 15 εκατ. Ευρώ και αφήνει υπονοούμενα για οικονομικά οφέλη της Δημοτικής αρχής. Για την υπόθεση ενήργησε προανάκριση η Ειρηνοδίκης Σαλαμίνας κατά παραγγελία της Εισαγγελίας Πειραιά.
Άλλος «κουκουλοφόρος» με το όνομα Παπαϊωάννου, απείλησε τηλεφωνικά την Διευθύντρια του Ταμείου Συνοχής στην Ελλάδα προκαλώντας δυσμενή σχόλια σε βέρος των κατοίκων της Σαλαμίνας και δυσφημίζοντας το νησί μας.
Οι πιέσεις, οι ανυπόστατες καταγγελίες και οι εκβιασμοί είχαν ως αποτέλεσμα την παραίτηση από την Επιτροπή παρακολούθησης του έργου υπαλλήλων του Δήμου προκαλώντας έτσι εμπόδια στην ομαλή πορεία του έργου.
Όλα αυτά, τόνισε ο κ. Δήμαρχος δεν πρόκειται να ανακόψουν την πορεία του έργου. Μετά την ολοκλήρωση κατά 90% των εργασιών του τμήματος που προβλέπεται η λειτουργία του με το βαρυτικό σύστημα στην περιοχή Τσάμη θα ακολουθήσει, εντός των ημερών, η έναρξη των εργασιών στη Λ. Φανερωμένης και Βόρεια αυτής στις περιοχές Αλώνια και Μπόσκο. Εξέφρασε δε τη βεβαιότητα ότι οι εργασίες που προβλέπονται από τη μελέτη θα ολοκληρωθούν μέσα στις προθεσμίες που έχουν τεθεί από το Ταμείο Συνοχής της Ε.Ε. (τέλος του 2009).
Στη συνέχεια ο κ. Δήμαρχος δέχτηκε σε ερωτήσεις από δημότες και που αφορούσαν κυρίως τμήματα τα οποία δεν καλύπτονται από την υπάρχουσα μελέτη (π.χ. Άγιος Νικόλαος, Εργατικές Κατοικίες κ. ά.). Απαντώντας ο κ. Δήμαρχος είπε ότι ο Δήμος θα προβεί στη σύνταξη νέας μελέτης η οποία θα καλύπτει τις παραπάνω περιοχές αλλά και άλλες που δεν εξυπηρετούνται από την υπάρχουσα μελέτη.